Sekwencjonowanie genomowe wraz z usługami dodatkowymi, tj. przygotowaniem bibliotek oraz podstawową analizą bioinformatyczną

Usługi doradcze w zakresie działalności gospodarczej, w tym usługi badawcze i eksperymentalno-rozwojowe

Tryb zamówienia	Wynik
Rodzaj zamówienia	Usługi
Tytuł	Sekwencjonowanie genomowe wraz z usługami dodatkowymi, tj. przygotowaniem bibliotek oraz podstawową analizą bioinformatyczną
Zamawiający	Dostępne dla zalogowanych
Miejsce realizacji	Puławy
Data publikacji	2025-12-19
Kod CPV	731110003 Laboratoryjne usługi badawcze
Numer wyniku	6816037

<body><h1>Ogłoszenie o wykonaniu umowy<br>Usługi<br>Sekwencjonowanie genomowe wraz z usługami dodatkowymi, tj. przygotowaniem bibliotek oraz podstawową analizą bioinformatyczną</h1><h2>SEKCJA I - ZAMAWIAJĄCY</h2><h3>1.1.) Nazwa zamawiającego:<span>Państwowy Instytut Weterynaryjny - Państwowy Instytut Badawczy</span></h3><h3>1.3.) Krajowy Numer Identyfikacyjny:<span>REGON 000080252</span></h3><h3>1.4) Adres zamawiającego</h3><h3>1.4.1.) Ulica:<span>Al. Partyzantów 57</span></h3><h3>1.4.2.) Miejscowość:<span>Puławy</span></h3><h3>1.4.3.) Kod pocztowy:<span>24-100</span></h3><h3>1.4.4.) Województwo:<span>lubelskie</span></h3><h3>1.4.5.) Kraj:<span>Polska</span></h3><h3>1.4.6.) Lokalizacja NUTS 3:<span>PL815 - Puławski</span></h3><h3>1.4.9.) Adres poczty elektronicznej:<span>przetargi@piwet.pulawy.pl</span></h3><h3>1.4.10.) Adres strony internetowej zamawiającego:<span>www.piwet.pulawy.pl</span></h3><h3>1.5.) Rodzaj zamawiającego:<span>Zamawiający publiczny - osoba prawna, o której mowa w art. 4 pkt 3 ustawy (podmiot prawa publicznego)</span></h3><h2>SEKCJA II – INFORMACJE PODSTAWOWE</h2><h3>2.1.) Identyfikator postępowania:<span>ocds-148610-96b23090-498f-4aaa-a1b0-916ea1143069</span></h3><h3>2.2.) Numer ogłoszenia:<span>2025/BZP 00610723</span></h3><h3>2.3.) Wersja ogłoszenia:<span>01</span></h3><h3>2.4.) Data ogłoszenia:<span>2025-12-19</span></h3><h2>SEKCJA III – PODSTAWOWE INFORMACJE O POSTĘPOWANIU W WYNIKU KTÓREGO ZOSTAŁA ZAWARTA UMOWA</h2><h3>3.1.) Charakter zamówienia:</h3><p>Zamówienie klasyczne - od 130 000 zł, ale o wartości mniejszej niż progi unijne</p><h3>3.2.) Zamówienie było poprzedzone ogłoszeniem o zamówieniu albo ogłoszeniem o zamiarze zawarcia umowy w BZP lub Dz. Urz. UE:<span>Tak</span></h3><h3>3.2.1.) Numer ogłoszenia w BZP lub Dz. Urz. UE:<span>2025/BZP 00436897</span></h3><h3>3.3.) Czy zamówienie dotyczy projektu lub programu współfinansowanego ze środków Unii Europejskiej:</h3><p>Nie</p><h3>3.5.) Tryb udzielenia zamówienia wraz z podstawą prawną:</h3><p>Zamówienie udzielane jest w trybie podstawowym na podstawie: art. 275 pkt 1 ustawy</p><h3>3.6.) Rodzaj zamówienia:</h3><p>Usługi</p><h3>3.7.) Nazwa zamówienia:</h3><p>Sekwencjonowanie genomowe wraz z usługami dodatkowymi, tj. przygotowaniem bibliotek oraz podstawową analizą bioinformatyczną</p><h3>3.8.) Krótki opis przedmiotu zamówienia:</h3><p>Przedmiotem usługi jest sekwencjonowanie genomowe wraz z usługami dodatkowymi, tj. przygotowaniem bibliotek oraz podstawową analizą bioinformatyczną.<br><br>Próbki będą wysłane jednorazowo (planowany termin wysłania próbek: październik-listopad 2025 r.).<br><br>Przewidywana ilość prób w czasie trwania umowy będzie wynosiła około 54 próbek.<br><br>Minimalne wymagane parametry usługi:<br>przygotowanie bibliotek do sekwencjonowania w trybie odczytów dwustronnych (sparowanych), długość insertu miedzy adapterami powinna być tak dobrana, aby umożliwić odczyt o długości 300 pz w każdą stronę;<br>sekwencjonowanie genomowe w technologii Illumina, platforma MiSeq w trybie odczytów dwustronnych (pair-end), konfiguracja przebiegu sekwencjonowania 2x300bp;<br>sekwencjonowanie z minimalnym pokryciem 70x<br>podstawowa analiza bioinformatyczna (przycinanie odczytów, ocena jakości sekwencji, przygotowanie plików wynikowych w formacie fasta oraz danych surowych w formacie fastQ)<br>ilość odczytów Q30 powyżej 75%<br><br>Do Wykonawcy, w celu wykonania usługi, przesłane będą próbki w postaci materiału genetycznego (DNA bakterii):<br>- Listeria monocytogenes (wielkość genomu ok. 2,9 Mb) – planowana liczba ok. 7 próbek<br>- Salmonella spp. (wielkość genomu ok. 4,78 Mb) – planowana liczba ok. 2 próbek<br>- Yersinia spp. (wielkość genomu ok. 4,6 Mb) - planowana liczba ok. 15 próbek<br>- Staphylococcus aureus (wielkość genomu ok. 2,8 Mb)- planowana liczba ok. 30 próbek</p><h3>3.9.) Główny kod CPV:<span>73111000-3 - Laboratoryjne usługi badawcze</span></h3><h2>SEKCJA IV – PODSTAWOWE INFORMACJE O ZAWARTEJ UMOWIE</h2><h3>4.1.) Data zawarcia umowy:<span>2025-11-12</span></h3><h3>4.2.) Okres realizacji zamówienia:</h3>28 dni<h3>4.3.) Dane wykonawcy, z którym zawarto umowę:</h3><h3>4.3.1.) Nazwa (firma) wykonawcy, któremu udzielono zamówienia (w przypadku wykonawców ubiegających się wspólnie o udzielenie zamówienia – dotyczy pełnomocnika, o którym mowa w art. 58 ust. 2 ustawy):<span>Genomed S.A.</span></h3><h3>4.3.2.) Krajowy Numer Identyfikacyjny:<span>PL7010083563</span></h3><h3>4.3.3.) Ulica:<span>Ponczowa 12</span></h3><h3>4.3.4.) Miejscowość:<span>Warszawa</span></h3><h3>4.3.5.) Kod pocztowy:<span>02-971</span></h3><h3>4.3.6.) Województwo:<span>mazowieckie</span></h3><h3>4.3.7.) Kraj:<span>Polska</span></h3><h3>4.4.) Wartość umowy:<span>40649,04                PLN</span></h3><h3>4.5.) Numer ogłoszenia o wyniku postępowania zamieszczonego w BZP lub numer ogłoszenia o udzieleniu zamówienia opublikowanego w Dzienniku Urzędowym Unii Europejskiej:<span>2025/BZP 00534425/01</span></h3><h2>SEKCJA V PRZEBIEG REALIZACJI UMOWY</h2><h3>5.1.) Czy umowa została wykonana:<span>Tak</span></h3><h3>5.2.) Termin wykonania umowy:<span>2025-12-09</span></h3><h3>5.3.) Czy umowę wykonano w pierwotnie określonym terminie:<span>Tak</span></h3><h3>5.4.) Informacje o zmianach umowy</h3><h3>5.4.1.) Liczba zmian:<span>0</span></h3><h3>5.5.) Łączna wartość wynagrodzenia wypłacona z tytułu zrealizowanej umowy:<span>39896,28                PLN</span></h3><h3>5.6.) Czy umowa została wykonana należycie:<span>Tak</span></h3><h3>5.7.) Podczas realizacji zamówienia zamawiający kontrolował przewidziane w zawartej umowie wymagania:</h3><p>nie dotyczy</p></body>