dostarczenie bazy danych próbek cytologicznych płuc

Usługi informatyczne: konsultacyjne, opracowywania oprogramowania, internetowe i wsparcia, w tym dostawy

Tryb zamówienia	Zapytanie ofertowe
Rodzaj zamówienia	Usługi
Tytuł	dostarczenie bazy danych próbek cytologicznych płuc
Zamawiający	Dostępne dla zalogowanych
Miejsce realizacji	Warszawa
Data publikacji	2025-11-27
Data składania ofert	29/12/2025, Godzina 23:59
Dokumenty do pobrania	Dostępne dla zalogowanych
Kod CPV	723000008 Usługi w zakresie danych 723200004 Usługi bazy danych 723190004 Usługi dostarczania danych
Numer przetargu	6743161

<div>
 <h1>Zapytanie ofertowe na dostarczenie bazy danych próbek cytologicznych płuc na potrzeby firmy ALCID Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością w ramach projektu pt. „Narzędzie bioinformatyczne do automatyzacji diagnostyki chorób układu oddechowego z wykorzystaniem obrazów 3D komórek przy wykorzystaniu narzędzi Deep Learning” w ramach Piorytetu II Środowisko sprzyjające innowacjom; Działanie 2.09 Seal of Excellence – Fundusze Europejskie dla Nowoczesnej Gospodarki 2021–2027 (FENG).</h1>

<h2>Załączniki</h2>
 <ul>
 <li>27112025 zalaczniki.docx</li>
 <li>27112025 zapytanie ofertowe baza danych.pdf</li>
 </ul>
 
 <h2>Części zamówienia</h2>

<h3>dostarczenie bazy danych próbek cytologicznych płuc </h3>
 Przedmioty zamówienia
 Przedmiotem zamówienia jest dostarczenie bazy danych próbek cytologicznych płuc na potrzeby firmy ALCID Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością w ramach projektu pt. „Narzędzie bioinformatyczne do automatyzacji diagnostyki chorób układu oddechowego z wykorzystaniem obrazów 3D komórek przy wykorzystaniu narzędzi Deep Learning” w ramach Priorytetu II Środowisko sprzyjające innowacjom; Działanie 2.09 Seal of Excellence – Fundusze Europejskie dla Nowoczesnej Gospodarki 2021–2027 (FENG). 
 
1.	Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia: 
Wymagania ilościowe 
Dostarczony zbiór danych musi obejmować co najmniej 5 000 unikalnych, cyfrowych preparatów cytologicznych (WSI). Preparaty muszą pochodzić z różnych, niezależnych źródeł (np. z kilku banków danych lub laboratoriów), aby zapewnić heterogeniczność danych, co jest kluczowe dla zminimalizowania ryzyka błędu systematycznego (ang. bias) w trenowanych modelach AI i zwiększenia ich zdolności do generalizacji. 
Wymagania techniczne i jakościowe 
Dane obrazowe (Whole Slide Images - WSI) 
●	Formaty plików: Akceptowane są powszechnie stosowane w patologii cyfrowej formaty WSI, w tym m.in.: SVS, VSI, NDPI, MRXS, TIFF. 
●	Jakość skanów: Wszystkie obrazy WSI muszą być zeskanowane w rozdzielczości diagnostycznej, odpowiadającej powiększeniu obiektywu co najmniej 20x. 
●	Dane 3D (Z-stack): Z uwagi na innowacyjny charakter projektu, który zakłada wykorzystanie obrazów 3D, Zamawiającemu zależy, aby obrazy zawierały dane z informacją z wielu płaszczyzn ostrości (tzw. Z-stack). – minimum 4 % obrazów - zakres ten stanowi KRYTERIUM OCENY OFERT. 
Skład i różnorodność zbioru danych 
Dostarczony zbiór danych musi być zróżnicowany i reprezentatywny dla realnej praktyki klinicznej w diagnostyce cytologicznej chorób płuc. Kluczowym wymogiem jest zapewnienie odpowiedniej dystrybucji preparatów pomiędzy pięcioma głównymi kategoriami diagnostycznymi zdefiniowanymi przez Światową Organizację Zdrowia (WHO) w ramach systemu raportowania cytopatologii płuc (The WHO Reporting System for Lung Cytopathology). Taka struktura zbioru danych jest niezbędna do wytrenowania solidnego i wiarygodnego modelu AI, zdolnego do pracy nie tylko z przypadkami jednoznacznymi, ale również z materiałem nieoptymalnym lub atypowym, co stanowi największe wyzwanie w codziennej diagnostyce. 
Poniższa tabela określa minimalny, wymagany udział procentowy poszczególnych kategorii diagnostycznych w całym dostarczonym zbiorze danych. 
Tabela 1: Wymagana Dystrybucja Kategorii Diagnostycznych 
Kategoria Diagnostyczna (wg. WHO Reporting System for Lung Cytopathology)	Wymagany Minimalny Udział Procentowy w Całym Zbiorze	Uzasadnienie i Uwagi 
Niewystarczający/Nieadekwatny/Niediagnostyczny (Insufficient/Inadequate/Non-diagnostic)	min. 5%	Niezbędne do trenowania modelu w zakresie oceny jakości i adekwatności próbki, co jest pierwszym krokiem w każdej realnej diagnostyce i pozwala na automatyczne odrzucanie materiału nienadającego się do analizy 
Zmiany Łagodne (Benign)	min. 30%	Stanowi podstawę dla zdefiniowania &quot;normy&quot; i jest najczęstszą kategorią w badaniach przesiewowych. Kluczowe dla minimalizacji wyników fałszywie dodatnich i zapewnienia wysokiej specyficzności modelu. 
Atypia (Atypical)	min. 20%	Kategoria o kluczowym znaczeniu klinicznym, reprezentująca przypadki niejednoznaczne, które stanowią największe wyzwanie dla diagnostów. Zdolność AI do poprawnej klasyfikacji tych przypadków jest miarą jej zaawansowania i realnej użyteczności. 
Podejrzenie Złośliwości (Suspicious for Malignancy)	min. 20%	Reprezentuje przypadki o wysokim ryzyku złośliwości, które wymagają dalszej, często inwazyjnej weryfikacji. Krytyczne dla trenowania wysokiej czułości modelu i minimalizacji wyników fałszywie ujemnych. 
Zmiany Złośliwe (Malignant)	min. 20%	Obejmuje jednoznaczne przypadki nowotworowe. Niezbędne do nauki kluczowych cech morfologicznych komórek rakowych. Zbiór powinien zawierać różne typy nowotworów płuc (np. niedrobnokomórkowy, drobnokomórkowy) w celu zapewnienia szerokiego spektrum patologii. 
Wymagania dotyczące metadanych 
●	Struktura i powiązanie danych: Każdy plik WSI musi być jednoznacznie powiązany z anonimowym, unikalnym identyfikatorem pacjenta oraz unikalnym identyfikatorem przypadku klinicznego. Struktura dostarczonych danych musi umożliwiać łatwe i jednoznaczne grupowanie wszystkich preparatów należących do tego samego przypadku. 
●	Wymagane Pola Metadanych: Dla każdego przypadku klinicznego muszą zostać dostarczone następujące dane w formie ustrukturyzowanej (np. w pliku CSV, JSON): 
○	Anonimowy wiek pacjenta w momencie diagnozy. 
○	Płeć pacjenta. 
○	Typ pobranego materiału cytologicznego (np. popłuczyny oskrzelowo-pęcherzykowe (BAL), wymaz szczoteczkowy z oskrzeli, biopsja aspiracyjna cienkoigłowa (FNAB). 
○	Ostateczna diagnoza/opis patomorfologiczny, zgodny z przypisaną kategorią WHO. W przypadku kategorii &quot;Zmiany Złośliwe&quot;, wymagane jest podanie konkretnego typu histologicznego nowotworu, jeśli jest znany. 
Zamawiający informuje, że dane muszą pochodzić z realnych źródeł. Baza danych musi być autentyczna. 
Zamawiający ma prawo zażądać próbki danych min. 15 preparatów ( w tym przynajmniej 5 szt., w formacie 3D) przed podpisaniem umowy z Wybranym Wykonawca, aby zweryfikować poprawność. Dodatkowo w przypadku stwierdzenia nieprawidłowości w próbce Zamawiający ma prawo odstąpić od podpisania umowy i odrzucić ofertę. 
 
Informacje ogólne: 
 
1.	Wyłoniony Wykonawca zapewni w ramach wynagrodzenia dostawę wymaganej Bazy danych. 
2.	Przedmiot zamówienia zostanie wykonany z najwyższą starannością, zgodnie z wytycznymi ze strony Zamawiającego, wynikającą z zawodowego charakteru jego działalności i w sposób gwarantujący pełne i prawidłowe zabezpieczenie interesów Zamawiającego 
3.	Miejscem dostarczenia przedmiotu zamówienia jest miejsce realizacji projektu wskazane przez Zamawiającego, zgodnie z niniejszym Zapytaniem Ofertowym. 
4.	Mogące wystąpić w Zapytaniu ofertowym znaki towarowe, pochodzenia czy patenty mają charakter wyłącznie przykładowy, a ich wskazanie ma na celu określenie oczekiwanego standardu przy czym Zamawiający informuje, że dopuszcza możliwość zastosowania równoważnych rozwiązań. 
5.	W razie opisania Przedmiotu zamówienia za pomocą norm, aprobat, specyfikacji technicznych Zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne. 
6.	Za rozwiązania równoważne należy rozumieć takie, które przedstawiają opis przedmiotu zamówienia o takich samych lub lepszych parametrach technicznych, jakościowych, funkcjonalnych spełniających minimalne parametry określone przez Zamawiającego, lecz oznaczone innym np. znakiem towarowym, patentem lub pochodzeniem, normą, czy aprobatą. Wykonawca, który powołuje się na rozwiązania równoważne w opisywanym przez Zamawiającego przedmiocie zamówienia, jest obowiązany udowodnić, że proponowane przez niego rozwiązania w równoważnym stopniu spełniają wymagania określone w zapytaniu ofertowym. 
7.	Zamawiający wymaga od Wykonawcy złożenia stosownych dokumentów uwiarygadniających zastosowanie rozwiązań równoważnych. W przypadku, gdy Wykonawca nie złoży w ofercie dokumentów o zastosowaniu innych równoważnych materiałów lub rozwiązań, to rozumie się przez to, że do kalkulacji ceny oferty i wykonania przedmiotu zamówienia ujęto materiały zaproponowane w szczegółowym opisie przedmiotu zamówienia; w związku z tym Wykonawca jest zobowiązany zastosować do wykonania zamówienia materiały lub rozwiązania zaproponowane w Szczegółowym opisie przedmiotu zamówienia. 
8.	Wykonawca wraz z Przedmiotem zamówienia dostarczy Zamawiającemu następujące dokumenty: 
a.	Raport tabelaryczny dot. dostarczonej bazy danych. 
b.	Oświadczenie o prawidłowości danych w bazie i pochodzeniu z realnych źródeł

Okres gwarancji: nie dotyczy
 
 <h2>Kryteria oceny</h2>
 Oferta za kryterium „cena netto przedmiotu zamówienia” może otrzymać maksymalnie 80 pkt.Szczegółowy opis znajduje się w punkcie VII w zapytaniu ofertowym.
 Szczegółowy opis znajduje się w punkcie VII w zapytaniu ofertowym. Oferta za kryterium „ILOŚĆ PROCENTOWA DOSTARCZONYCH OBRAZÓW 3D Z INFORMACJA Z WIELU PŁASZCZYZN OSTROŚCI” może otrzymać maksymalnie 20 pkt.
 
 <h2>Warunki zmiany umowy</h2>

ISTOTNE ZMIANY WARUNKÓW UMOWY 
Zamawiający przewiduje możliwość zmian postanowień zawartej umowy w stosunku do treści oferty na podstawie której dokonano wyboru Wykonawcy, w przypadku wystąpienia, co najmniej jednej z okoliczności wymienionych poniżej, z uwzględnieniem podawanych warunków ich wprowadzenia, tj.: 
a)	zmiany dotyczą realizacji dodatkowych dostaw od dotychczasowego wykonawcy nieobjętych zamówieniem podstawowym, o ile stały się niezbędne i zostały spełnione łącznie następujące warunki: 
•	zmiana wykonawcy nie może zostać dokonana z powodów ekonomicznych lub technicznych, w szczególności dotyczących zamienności lub interoperacyjności sprzętu, usług lub instalacji, zamówionych w ramach zamówienia podstawowego, 
•	zmiana wykonawcy spowodowałaby istotną niedogodność lub znaczne zwiększenie kosztów dla Zamawiającego, 
•	wartość każdej kolejnej zmiany nie przekracza 50% wartości zamówienia określonej pierwotnie w umowie, 
b)	zmiana nie prowadzi do zmiany charakteru umowy i zostały spełnione łącznie następujące warunki: 
•	konieczność zmiany umowy spowodowana jest okolicznościami, których Zamawiający, działając z należytą starannością, nie mógł przewidzieć, 
•	wartość zmiany nie przekracza 50% wartości zamówienia określonej pierwotnie 
w umowie, 
c)	wykonawcę, któremu Zamawiający udzielił zamówienia, ma zastąpić nowy wykonawca: 
•	w wyniku sukcesji, wstępując w prawa i obowiązki wykonawcy, w następstwie przejęcia, połączenia, podziału, przekształcenia, upadłości, restrukturyzacji, dziedziczenia lub nabycia dotychczasowego wykonawcy lub jego przedsiębiorstwa, o ile nowy wykonawca spełnia warunki udziału w postępowaniu oraz nie pociąga to za sobą innych istotnych zmian umowy, a także nie ma na celu uniknięcia stosowania zasady konkurencyjności, 
lub, 
•	w wyniku przejęcia przez Zamawiającego zobowiązań wykonawcy względem jego podwykonawców – w przypadku zmiany podwykonawcy Zamawiający może zawrzeć umowę z nowym podwykonawcą bez zmiany warunków realizacji zamówienia z uwzględnieniem dokonanych płatności z tytułu dotychczas zrealizowanych prac, 
d)	zmiana nie prowadzi do zmiany charakteru umowy a łączna wartość zmian jest mniejsza niż 140 000 EUR i jednocześnie jest mniejsza od 10% wartości zamówienia określonej pierwotnie w umowie 
e)	zmiana sposobu rozliczania umowy, dokonywania płatności lub konieczność zmiany terminu realizacji na rzecz każdej ze Stron, na umotywowany ich wniosek, 
f)	wystąpienia siły wyższej, 
 
1.	Zmiany umowy wymagają dla swej ważności aneksu w formie pisemnej pod rygorem nieważności.
 </div>